Το Τμήμα Ιατρικής συνεργάζεται στενά με τα Νοσοκομεία της πόλης της Θεσσαλονίκης και οι Κλινικές του στεγάζονται στα παρακάτω Νοσοκομεία:
Πανεπιστημιακό Γενικό Νοσοκομείο Θεσσαλονίκης «ΑΧΕΠΑ»
Στίλπωνος Κυριακίδη 1, 54636, Θεσσαλονίκη
http://www.ahepahosp.gr/
Γενικό Νοσοκομείο Θεσσαλονίκης «Γ. Γεννηματάς-Ο Άγιος Δημήτριος»
Εθνικής Αμύνης 41, 54635, Θεσσαλονίκη
http://www.gennimatas-thess.gr/
Γενικό Νοσοκομείο Θεσσαλονίκης «Ιπποκράτειο»
Κωνσταντινουπόλεως 49, 54642, Θεσσαλονίκη
http://www.ippokratio.gr/
Νοσοκομείο Αφροδισίων & Δερματικών Νόσων Θεσσαλονίκης
Δελφών 124, 54643, Θεσσαλονίκη
http://www.nadn.gr/
Γενικό Νοσοκομείο Θεσσαλονίκης «Παπαγεωργίου»
Περιφερειακή οδός, 56403, Ν. Ευκαρπία
http://www.papageorgiou-hospital.gr/
Γενικό Νοσοκομείο Θεσσαλονίκης «Γ. Παπανικολάου»
Λεωφόρος Παπανικολάου, 57010, Εξοχή
http://gpapanikolaou.gr/
Ψυχιατρικό Νοσοκομείο Θεσσαλονίκης
Κωνσταντινουπόλεως 36, 56429, Σταυρούπολη
http://www.psychothes.gr/
